Företaget grundades 1978 och verksamheten bedrevs under namnet Extrico Data AB fram till 1999 då namnbyte gjordes med dotterbolaget Agda Lön AB. Den tidiga verksamheten bestod i utveckling av systemverktyg och lönesystem i stordatormiljö.
Utvecklingen av Agda Classic, ett lönesystem för mikrodatorer, påbörjades 1981 på uppdrag av dåvarande SAF:s Allmänna Grupp (nuvarande förbundet Almega inom Svenskt Näringsliv). Arbetet med Agda Classic pågick fortlöpande fram tills 2007 och har gett företaget dess nuvarande inriktning.
Det tidigare dotterbolaget Agda Lön AB emanerar ur Svenska Lön AB som var huvudman för Agda Classic fram till 1993, då Agda Lön AB tog över Agdadelen i företaget. Verksamhet med lönesystem för drift i stordatormiljö övertogs av andra företag.
I mitten på 90-talet påbörjades utvecklingen av ett nytt system som blev Agda PS (Agda Personalsystem) som är ett verksamhetssystem för all personal, som t.ex. löneexpert, arbetsledare och anställd.